根据不同的口腔疾病问题，分为药物类型的漱口水（医学上也叫含漱口液）和保健型漱口水，我们日常使用时要区分开来选择，一般针对口腔疾病的含漱液是由医生开的或在药店也可自行购买，而普通漱口水我们在商超上就可以买到。
1、含漱液是一种通过口腔黏膜给药而发挥局部治疗作用的液体制剂，一般为药物的水溶液，也可含少量甘油和乙醇。含漱液中常加适量着色剂，提示用于漱口。一般作为牙周炎、牙龈炎、口腔溃疡等口腔炎症的辅助治疗。因其含有药物成分，长期使用可能会使口腔内菌群失调，造成其他的口腔疾病，所以不能长期使用，使用方法和用量需在医生指导下进行。
2、漱口水的主要成分是酒精、香精、表面活性剂、氟化物等，能暂时减少口腔内的细菌，可以作为日常的口腔健康护理，一般作用是抑菌清洁口腔，不能用于疾病的治疗，用法用量没有特别严格的要求。
此外，含漱口液和漱口水不易同时使用，至少要间隔2小时在使用其它款的漱口水，否则可能会发生药物之间的相互作用。并且两者漱口水中都含有消毒防腐成分，含漱时不宜咽下或吞下，否则会造成胃肠道吸收后的局部组织腐蚀。
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